Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms