Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SmoP56726 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SmoP56726 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SmoP56726 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SmoP56726 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SmoP56726 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SmoP56726 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SmoP56726 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmoP56726 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmoP56726 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmoP56726 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmoP56726 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmoP56726 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmoP56726 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmoP56726 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmoP56726 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmoP56726 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SmoP56726 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmoP56726 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmoP56726 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmoP56726 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmoP56726 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SmoP56726 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SmoP56726 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SmoP56726 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SmoP56726 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SmoP56726 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SmoP56726 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SmoP56726 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SmoP56726 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SmoP56726 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SmoP56726 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SmoP56726 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SmoP56726 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SmoP56726 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SmoP56726 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SmoP56726 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SmoP56726 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmoP56726 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmoP56726 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmoP56726 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmoP56726 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmoP56726 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmoP56726 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmoP56726 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmoP56726 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmoP56726 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmoP56726 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmoP56726 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmoP56726 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmoP56726 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SmoP56726 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SmoP56726 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SmoP56726 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SmoP56726 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SmoP56726 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SmoP56726 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SmoP56726 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SmoP56726 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SmoP56726 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SmoP56726 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SmoP56726 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SmoP56726 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SmoP56726 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SmoP56726 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SmoP56726 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SmoP56726 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SmoP56726 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SmoP56726 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SmoP56726 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SmoP56726 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SmoP56726 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SmoP56726 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SmoP56726 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SmoP56726 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SmoP56726 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SmoP56726 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SmoP56726 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SmoP56726 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SmoP56726 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SmoP56726 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SmoP56726 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SmoP56726 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SmoP56726 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SmoP56726 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SmoP56726 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SmoP56726 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SmoP56726 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SmoP56726 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SmoP56726 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SmoP56726 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SmoP56726 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SmoP56726 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SmoP56726 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SmoP56726 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SmoP56726 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SmoP56726 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SmoP56726 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SmoP56726 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SmoP56726 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms