Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lim2P56563 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lim2P56563 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lim2P56563 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lim2P56563 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lim2P56563 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lim2P56563 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lim2P56563 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lim2P56563 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lim2P56563 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lim2P56563 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms