Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf5P56477 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf5P56477 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf5P56477 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf5P56477 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf5P56477 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf5P56477 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf5P56477 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf5P56477 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf5P56477 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms