Protein–RNA interactions for Protein: P56391

Cox6b1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6b1P56391 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cox6b1P56391 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms