Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CdaP56389 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CdaP56389 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CdaP56389 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CdaP56389 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CdaP56389 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CdaP56389 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CdaP56389 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CdaP56389 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CdaP56389 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CdaP56389 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CdaP56389 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CdaP56389 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CdaP56389 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CdaP56389 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CdaP56389 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CdaP56389 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CdaP56389 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CdaP56389 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CdaP56389 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CdaP56389 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CdaP56389 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CdaP56389 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CdaP56389 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CdaP56389 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CdaP56389 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CdaP56389 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CdaP56389 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CdaP56389 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CdaP56389 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CdaP56389 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CdaP56389 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CdaP56389 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CdaP56389 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CdaP56389 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CdaP56389 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CdaP56389 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CdaP56389 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CdaP56389 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CdaP56389 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CdaP56389 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CdaP56389 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CdaP56389 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CdaP56389 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CdaP56389 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CdaP56389 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CdaP56389 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CdaP56389 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CdaP56389 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CdaP56389 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CdaP56389 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CdaP56389 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CdaP56389 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CdaP56389 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CdaP56389 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CdaP56389 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CdaP56389 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CdaP56389 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CdaP56389 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CdaP56389 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CdaP56389 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CdaP56389 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CdaP56389 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CdaP56389 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CdaP56389 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CdaP56389 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CdaP56389 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CdaP56389 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CdaP56389 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CdaP56389 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CdaP56389 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CdaP56389 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CdaP56389 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CdaP56389 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CdaP56389 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CdaP56389 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CdaP56389 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CdaP56389 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CdaP56389 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CdaP56389 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CdaP56389 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CdaP56389 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CdaP56389 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CdaP56389 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CdaP56389 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CdaP56389 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CdaP56389 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CdaP56389 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CdaP56389 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CdaP56389 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CdaP56389 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CdaP56389 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CdaP56389 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CdaP56389 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CdaP56389 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CdaP56389 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CdaP56389 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CdaP56389 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CdaP56389 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CdaP56389 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms