Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp1P55194 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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