Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pex2P55098 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pex2P55098 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pex2P55098 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pex2P55098 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pex2P55098 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pex2P55098 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pex2P55098 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pex2P55098 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms