Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GemP55041 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GemP55041 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GemP55041 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GemP55041 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GemP55041 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GemP55041 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GemP55041 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GemP55041 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GemP55041 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GemP55041 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GemP55041 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GemP55041 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GemP55041 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GemP55041 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GemP55041 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GemP55041 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GemP55041 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GemP55041 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GemP55041 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GemP55041 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GemP55041 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GemP55041 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GemP55041 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GemP55041 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GemP55041 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GemP55041 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GemP55041 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GemP55041 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GemP55041 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GemP55041 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GemP55041 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GemP55041 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GemP55041 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GemP55041 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GemP55041 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GemP55041 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GemP55041 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GemP55041 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GemP55041 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GemP55041 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GemP55041 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GemP55041 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GemP55041 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GemP55041 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GemP55041 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GemP55041 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GemP55041 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GemP55041 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GemP55041 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GemP55041 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GemP55041 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GemP55041 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GemP55041 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GemP55041 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GemP55041 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GemP55041 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GemP55041 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GemP55041 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GemP55041 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GemP55041 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GemP55041 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GemP55041 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GemP55041 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GemP55041 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GemP55041 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GemP55041 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GemP55041 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GemP55041 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GemP55041 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GemP55041 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GemP55041 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GemP55041 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GemP55041 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GemP55041 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GemP55041 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GemP55041 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GemP55041 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GemP55041 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GemP55041 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GemP55041 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GemP55041 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GemP55041 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GemP55041 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GemP55041 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GemP55041 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GemP55041 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GemP55041 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GemP55041 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GemP55041 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GemP55041 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GemP55041 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GemP55041 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GemP55041 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GemP55041 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GemP55041 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GemP55041 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GemP55041 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GemP55041 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GemP55041 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms