Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rad23bP54728 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms