Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rad23aP54726 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms