Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Efnb1P52795 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms