Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CitP49025 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CitP49025 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CitP49025 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CitP49025 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CitP49025 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CitP49025 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CitP49025 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CitP49025 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CitP49025 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CitP49025 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CitP49025 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CitP49025 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CitP49025 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CitP49025 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CitP49025 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CitP49025 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CitP49025 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CitP49025 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CitP49025 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CitP49025 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CitP49025 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CitP49025 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CitP49025 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CitP49025 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CitP49025 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CitP49025 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CitP49025 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CitP49025 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CitP49025 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CitP49025 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CitP49025 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CitP49025 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CitP49025 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CitP49025 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CitP49025 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CitP49025 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CitP49025 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CitP49025 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CitP49025 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CitP49025 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CitP49025 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CitP49025 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CitP49025 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CitP49025 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CitP49025 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CitP49025 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CitP49025 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CitP49025 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CitP49025 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CitP49025 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CitP49025 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CitP49025 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CitP49025 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CitP49025 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CitP49025 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CitP49025 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CitP49025 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CitP49025 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CitP49025 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CitP49025 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CitP49025 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CitP49025 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CitP49025 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CitP49025 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CitP49025 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CitP49025 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CitP49025 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CitP49025 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CitP49025 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CitP49025 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CitP49025 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CitP49025 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CitP49025 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CitP49025 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CitP49025 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CitP49025 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CitP49025 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CitP49025 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CitP49025 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CitP49025 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CitP49025 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CitP49025 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms