Protein–RNA interactions for Protein: P49003

Bmp5, Bone morphogenetic protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp5P49003 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp5P49003 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bmp5P49003 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms