Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms