Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prox1P48437 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prox1P48437 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prox1P48437 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prox1P48437 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prox1P48437 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prox1P48437 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prox1P48437 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prox1P48437 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms