Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfx1P48377 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfx1P48377 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms