Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn3P48299 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn3P48299 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn3P48299 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edn3P48299 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edn3P48299 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn3P48299 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn3P48299 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Edn3P48299 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Edn3P48299 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Edn3P48299 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Edn3P48299 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Edn3P48299 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Edn3P48299 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Edn3P48299 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Edn3P48299 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Edn3P48299 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Edn3P48299 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Edn3P48299 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Edn3P48299 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Edn3P48299 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Edn3P48299 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Edn3P48299 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms