Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VdrP48281 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VdrP48281 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VdrP48281 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VdrP48281 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VdrP48281 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VdrP48281 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VdrP48281 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VdrP48281 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VdrP48281 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VdrP48281 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VdrP48281 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VdrP48281 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VdrP48281 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VdrP48281 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VdrP48281 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VdrP48281 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VdrP48281 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VdrP48281 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VdrP48281 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VdrP48281 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VdrP48281 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VdrP48281 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VdrP48281 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VdrP48281 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VdrP48281 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VdrP48281 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VdrP48281 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VdrP48281 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VdrP48281 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VdrP48281 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VdrP48281 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VdrP48281 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VdrP48281 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VdrP48281 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VdrP48281 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VdrP48281 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VdrP48281 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VdrP48281 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VdrP48281 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VdrP48281 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VdrP48281 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VdrP48281 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VdrP48281 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VdrP48281 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VdrP48281 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VdrP48281 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VdrP48281 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VdrP48281 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VdrP48281 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VdrP48281 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VdrP48281 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
VdrP48281 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
VdrP48281 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VdrP48281 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VdrP48281 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VdrP48281 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VdrP48281 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VdrP48281 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VdrP48281 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VdrP48281 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VdrP48281 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VdrP48281 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VdrP48281 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VdrP48281 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VdrP48281 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VdrP48281 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VdrP48281 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VdrP48281 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VdrP48281 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VdrP48281 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VdrP48281 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VdrP48281 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VdrP48281 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VdrP48281 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VdrP48281 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VdrP48281 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VdrP48281 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VdrP48281 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VdrP48281 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VdrP48281 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VdrP48281 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VdrP48281 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VdrP48281 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VdrP48281 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VdrP48281 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VdrP48281 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VdrP48281 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VdrP48281 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VdrP48281 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VdrP48281 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VdrP48281 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VdrP48281 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VdrP48281 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VdrP48281 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VdrP48281 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VdrP48281 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VdrP48281 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VdrP48281 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VdrP48281 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms