Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sipa1P46062 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sipa1P46062 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms