Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ThpoP40226 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ThpoP40226 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ThpoP40226 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ThpoP40226 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ThpoP40226 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ThpoP40226 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ThpoP40226 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ThpoP40226 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ThpoP40226 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ThpoP40226 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms