Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timp3P39876 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timp3P39876 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timp3P39876 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timp3P39876 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp3P39876 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp3P39876 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp3P39876 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp3P39876 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timp3P39876 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms