Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tjp1P39447 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tjp1P39447 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tjp1P39447 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tjp1P39447 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tjp1P39447 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tjp1P39447 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tjp1P39447 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tjp1P39447 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tjp1P39447 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tjp1P39447 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tjp1P39447 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tjp1P39447 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tjp1P39447 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tjp1P39447 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tjp1P39447 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tjp1P39447 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms