Protein–RNA interactions for Protein: P36371

Tap2, Antigen peptide transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap2P36371 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap2P36371 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tap2P36371 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tap2P36371 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tap2P36371 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap2P36371 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap2P36371 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap2P36371 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap2P36371 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap2P36371 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms