Protein–RNA interactions for Protein: P35831

Ptpn12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn12P35831 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpn12P35831 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn12P35831 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn12P35831 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms