Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Grin2aP35436 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Grin2aP35436 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Grin2aP35436 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms