Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stfa1P35175 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms