Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms