Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc3P33622 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc3P33622 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms