Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh15P33146 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdh15P33146 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms