Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa11P31311 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa11P31311 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms