Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd3P30282 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccnd3P30282 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms