Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp3P28862 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp3P28862 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp3P28862 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms