Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NapbP28663 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NapbP28663 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NapbP28663 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NapbP28663 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NapbP28663 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NapbP28663 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NapbP28663 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NapbP28663 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NapbP28663 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NapbP28663 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NapbP28663 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NapbP28663 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NapbP28663 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NapbP28663 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NapbP28663 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NapbP28663 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NapbP28663 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NapbP28663 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NapbP28663 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NapbP28663 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NapbP28663 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NapbP28663 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NapbP28663 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NapbP28663 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NapbP28663 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NapbP28663 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NapbP28663 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NapbP28663 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NapbP28663 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NapbP28663 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NapbP28663 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NapbP28663 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NapbP28663 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NapbP28663 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NapbP28663 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NapbP28663 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NapbP28663 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NapbP28663 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NapbP28663 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NapbP28663 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NapbP28663 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NapbP28663 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NapbP28663 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NapbP28663 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NapbP28663 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NapbP28663 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NapbP28663 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NapbP28663 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NapbP28663 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NapbP28663 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NapbP28663 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NapbP28663 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NapbP28663 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NapbP28663 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NapbP28663 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NapbP28663 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NapbP28663 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NapbP28663 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NapbP28663 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NapbP28663 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NapbP28663 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NapbP28663 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NapbP28663 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NapbP28663 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NapbP28663 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NapbP28663 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NapbP28663 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NapbP28663 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NapbP28663 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NapbP28663 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NapbP28663 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NapbP28663 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NapbP28663 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NapbP28663 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NapbP28663 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NapbP28663 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NapbP28663 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NapbP28663 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NapbP28663 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NapbP28663 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NapbP28663 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NapbP28663 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NapbP28663 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NapbP28663 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NapbP28663 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NapbP28663 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NapbP28663 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NapbP28663 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NapbP28663 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NapbP28663 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NapbP28663 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NapbP28663 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NapbP28663 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NapbP28663 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NapbP28663 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NapbP28663 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NapbP28663 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NapbP28663 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NapbP28663 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms