Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col2a1P28481 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms