Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb3P28231 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms