Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vav1P27870 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vav1P27870 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vav1P27870 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vav1P27870 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vav1P27870 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Vav1P27870 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vav1P27870 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vav1P27870 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vav1P27870 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vav1P27870 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vav1P27870 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vav1P27870 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vav1P27870 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vav1P27870 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vav1P27870 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vav1P27870 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vav1P27870 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms