Protein–RNA interactions for Protein: P27784

Ccl6, C-C motif chemokine 6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl6P27784 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms