Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl3P27659 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms