Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc5P27641 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc5P27641 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc5P27641 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc5P27641 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc5P27641 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc5P27641 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc5P27641 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc5P27641 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrcc5P27641 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrcc5P27641 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrcc5P27641 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrcc5P27641 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrcc5P27641 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xrcc5P27641 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xrcc5P27641 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xrcc5P27641 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Xrcc5P27641 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xrcc5P27641 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Xrcc5P27641 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xrcc5P27641 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xrcc5P27641 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Xrcc5P27641 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
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