Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SarsP26638 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SarsP26638 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SarsP26638 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SarsP26638 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SarsP26638 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SarsP26638 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SarsP26638 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SarsP26638 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SarsP26638 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SarsP26638 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SarsP26638 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SarsP26638 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SarsP26638 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SarsP26638 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SarsP26638 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SarsP26638 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SarsP26638 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SarsP26638 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SarsP26638 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SarsP26638 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SarsP26638 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SarsP26638 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SarsP26638 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SarsP26638 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SarsP26638 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SarsP26638 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SarsP26638 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SarsP26638 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SarsP26638 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SarsP26638 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SarsP26638 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SarsP26638 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SarsP26638 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SarsP26638 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SarsP26638 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarsP26638 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarsP26638 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarsP26638 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarsP26638 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarsP26638 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SarsP26638 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarsP26638 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SarsP26638 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarsP26638 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SarsP26638 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SarsP26638 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SarsP26638 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SarsP26638 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SarsP26638 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SarsP26638 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SarsP26638 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SarsP26638 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SarsP26638 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SarsP26638 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SarsP26638 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SarsP26638 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SarsP26638 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SarsP26638 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SarsP26638 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SarsP26638 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SarsP26638 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SarsP26638 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SarsP26638 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SarsP26638 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SarsP26638 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SarsP26638 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SarsP26638 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms