Protein–RNA interactions for Protein: P25918

Cd19, B-lymphocyte antigen CD19, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd19P25918 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd19P25918 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd19P25918 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd19P25918 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd19P25918 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd19P25918 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd19P25918 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd19P25918 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd19P25918 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd19P25918 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd19P25918 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd19P25918 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd19P25918 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd19P25918 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd19P25918 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd19P25918 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd19P25918 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd19P25918 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd19P25918 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd19P25918 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd19P25918 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd19P25918 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd19P25918 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd19P25918 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd19P25918 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms