Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmo2P25801 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmo2P25801 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo2P25801 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms