Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdnP25233 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdnP25233 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdnP25233 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdnP25233 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdnP25233 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdnP25233 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdnP25233 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdnP25233 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdnP25233 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdnP25233 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdnP25233 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdnP25233 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdnP25233 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdnP25233 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NdnP25233 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdnP25233 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdnP25233 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdnP25233 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdnP25233 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdnP25233 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NdnP25233 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdnP25233 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdnP25233 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdnP25233 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NdnP25233 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdnP25233 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NdnP25233 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdnP25233 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdnP25233 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdnP25233 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdnP25233 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdnP25233 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdnP25233 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdnP25233 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdnP25233 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NdnP25233 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdnP25233 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdnP25233 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdnP25233 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NdnP25233 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NdnP25233 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NdnP25233 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NdnP25233 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NdnP25233 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdnP25233 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdnP25233 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdnP25233 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NdnP25233 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdnP25233 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdnP25233 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdnP25233 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NdnP25233 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NdnP25233 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdnP25233 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdnP25233 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdnP25233 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NdnP25233 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdnP25233 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdnP25233 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdnP25233 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdnP25233 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdnP25233 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdnP25233 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NdnP25233 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NdnP25233 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdnP25233 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdnP25233 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdnP25233 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdnP25233 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdnP25233 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdnP25233 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NdnP25233 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdnP25233 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdnP25233 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdnP25233 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdnP25233 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NdnP25233 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms