Protein–RNA interactions for Protein: P23906

Irf2, Interferon regulatory factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2P23906 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf2P23906 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf2P23906 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf2P23906 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf2P23906 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf2P23906 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf2P23906 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf2P23906 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf2P23906 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf2P23906 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf2P23906 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf2P23906 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms