Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RarbP22605 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RarbP22605 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RarbP22605 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RarbP22605 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RarbP22605 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RarbP22605 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RarbP22605 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RarbP22605 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RarbP22605 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RarbP22605 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RarbP22605 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RarbP22605 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RarbP22605 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RarbP22605 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RarbP22605 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RarbP22605 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RarbP22605 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RarbP22605 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RarbP22605 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RarbP22605 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RarbP22605 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RarbP22605 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RarbP22605 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RarbP22605 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RarbP22605 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RarbP22605 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RarbP22605 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RarbP22605 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RarbP22605 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RarbP22605 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RarbP22605 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RarbP22605 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RarbP22605 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RarbP22605 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RarbP22605 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RarbP22605 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RarbP22605 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RarbP22605 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RarbP22605 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RarbP22605 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RarbP22605 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RarbP22605 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RarbP22605 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RarbP22605 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RarbP22605 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RarbP22605 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RarbP22605 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RarbP22605 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RarbP22605 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RarbP22605 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RarbP22605 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RarbP22605 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RarbP22605 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RarbP22605 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RarbP22605 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RarbP22605 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RarbP22605 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RarbP22605 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RarbP22605 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RarbP22605 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RarbP22605 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RarbP22605 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RarbP22605 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RarbP22605 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RarbP22605 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RarbP22605 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RarbP22605 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RarbP22605 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RarbP22605 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RarbP22605 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RarbP22605 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RarbP22605 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RarbP22605 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RarbP22605 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RarbP22605 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RarbP22605 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RarbP22605 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RarbP22605 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RarbP22605 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RarbP22605 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RarbP22605 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RarbP22605 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RarbP22605 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RarbP22605 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RarbP22605 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RarbP22605 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RarbP22605 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RarbP22605 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RarbP22605 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RarbP22605 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RarbP22605 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RarbP22605 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RarbP22605 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RarbP22605 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RarbP22605 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RarbP22605 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RarbP22605 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RarbP22605 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RarbP22605 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms