Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Myo5bP21271 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Myo5bP21271 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo5bP21271 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms