Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxb9P20615 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb9P20615 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms