Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou5f1P20263 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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