Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a1P19437 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a1P19437 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms